高通量测序，也叫“下一代测序”，最新的是三代测序，是一种快速测定大量DNA序列的技术，主要应用于DNA测序、RNA测序、表观遗传学等基因组测序及转录测序等，它有力地推动生物科学研究的发展，也与人类的生活与健康息息相关，在微生物与人体健康系统的生态平衡、新生儿疾病筛查、肿瘤的诊断与治疗、遗传病和耐药性检测等领域都有广泛的临床应用。
近日，宝德为世纪坛医院升级打造的高性能计算集群系统，提供了坚实可靠的计算和存储底座，助力医院高通量测序更加快速精准，为加速医院临床科研和成果转化奠定良好的基础。
首都医科大学附属北京世纪坛医院（文中简称“世纪坛医院”）是集医疗、教学、科研、预防和保健为一体的三级甲等综合医院，拥有高水平的医疗专家人才队伍，先进的医疗技术和设备、以及非常优秀的医疗水平，多次承担国际医疗援助、精准扶贫与国内对口援助、大型医疗保障任务。同时，医院坚持科研教学齐头并进，不断加强在医学创新和科研项目的投入，并且加强国际合作，全力打造示范新型的现代临床研究体系。世纪坛医院原有IT系统的服务对象非常广泛，既是各实验室、各学科方向的科研支撑平台，也是基因测序的核心计算和数据汇聚平台，所以用户数量很大而且离散度高、应用软件种类多而杂。随着科研业务发展和数据量的暴增，原系统在应对计算密集、网络密集、IO密集、耦合密集型等不同硬件需求，以及高并发、快速实时响应等要求面前开始显得无力，强稳定性、高扩展性和高度自动化运维的新型高性能计算集群呼之欲出。基于客户实际需求的深入调研，考虑到新系统主要是为承担实验后期的高通量测序任务，同时要存储测序后产生的日益增多的基因组数据，宝德为世纪坛医院升级打造了高性能集群系统，该系统集合宝德高密度四子星计算服务器PR2720TW、宝德大内存计算服务器PR4865P、宝德分布式并行存储PLStor、图形工作站PT6630W、宝德交换机及宝德集群管理软件于一体，整体可提供416个CPU计算核心、内存总量6.75TB、Tflops 峰值达29.08万亿次、并行存储裸容量1050TB的计算和存储算力；同时，系统采用100GB IB网络，可以有效保障大模型大数据集的需求，并利用现有采用管理网络，连接所有节点。此外，新系统配置的宝德集群管理套件，能提供集群的管理、监控、资源调度等使用接口和管理接口界面，非常方便客户的日常运维，帮助客户高效利用集群计算和存储资源，并且有效降低成本。客户表示，宝德高性能计算集群的硬件系统包含了登录/管理节点、高密度计算节点、大内存节点、分布式并行存储、千兆管理网络、万兆网络等硬件设备，软件系统包含了集群基础环境软件、集群系统管理软件、分布式并行存储系统软件、生信分析软件及流程中间件软件等，二者合力能为医院的高通量测序保驾护航。而且，在硬件系统上架安装、布线、加电、确保与现有设备的有效连接，软件集成的安装和实施，应用系统的集成和系统优化、测试和多维度的项目培训……在整个项目的交付和实施、测试过程中，宝德团队表现了高度专业性和责任心，既满足了医院科研支撑平台先进高效、稳定可靠的算力要求，又给科研工作和日常运维带来了超出预期的增值服务体验。科技的终极目标是服务于人类，高通量测序技术关系到人类基因和生命密码。国家发改委《“十四五”生物经济发展规划》提出，要加快发展高通量基因测序技术，推动以单分子测序为标志的新一代测序技术创新，不断提高基因测序效率、降低测序成本。宝德将继续发挥自身在信息科技领域的技术优势，携手广大合作伙伴，以更加先进的软硬件产品方案和全栈服务为包括世纪坛医院等在内的更广泛医疗卫生行业客户提供坚实的算力底座，助力中国医疗科技和医学科研行稳致远！
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